MOGLI O MENINO LOBO 2 começa no ponto em que terminou o original, pouco depois de Mogli ter deixado a selva. O menino lobo agora vive na aldeia, entre os homens, aprendendo pela primeira vez sobre o amor à família. Em sua nova vida tem um irmãozinho, Ranjan, e uma melhor amiga, Shanti.

Enquanto isso, na selva, Balú, sente muita saudade de Menino Lobo e vai até a vila para fazer uma visita. O menino fica encantado e segue seu amigo urso até a floresta sem avisar ninguém. Lá vive aventuras emocionantes - é hipnotizado pela cobra Kaa, participa da entusiástica dança dos macacos e se vê frente a frente com seu velho inimigo, o tigre Shere Khan. Ao final, Shanti e Balú precisam unir forças para ajudar seu amiguinho a derrotar o tigre feroz e Mogli precisa escolher entre seus velhos amigos e sua nova família.