"Scooby Doo! Cadê você, meu filho?". Se você não morou em Marte nos últimos 20 anos com certeza conhece essa frase célebre, dita num memorável sotaque nordestino, e que marcou a nossa infância (e provavelmente a de nossos pais também!). O dogue alemão Scooby Doo e seus amigos da Mistérios S/A fizeram sua carreira desvendando casos pra lá de esquisitos, e sempre descobrindo o bandido por trás do fantasma, no final.

Porém, depois de resolverem o Caso do Fantasma da Lua, a equipe se abala. Eles acabam entrando em atrito e se separando. Scooby e Salsicha (Matthew Lillard) ficam com o furgão e partem pra férias permanentes. Fred (Freddie Prinze Jr.) escreve um livro sobre si mesmo, Velma (Linda Cardellini) passa por uma série de terapias em grupo e Daphne (Sarah Michelle Gellar) aprende artes marciais.

Um dia todos eles recebem uma carta do misterioso sr. Emile Mondavarius, pedindo ajuda para resolver um mistério em seu parque temático, a "Ilha do Espanto". Logo, a Mistérios S/A está reunida outra vez para resolver um caso nunca visto antes, que está afetando as pessoas que vão ao parque.