Uma série de violentos terremotos está chacoalhando os Estados Unidos e o Professor Norton acredita que estes abalos se originam do fundo do mar. O cientista desenvolve um poderoso raio capaz de deter esses tremores e parte para as profundezas do oceano a bordo de seu submarino nuclear. O professor tem a companhia de Ray Crash Corrigan, tenente da Marinha, uma repórter e do pequeno Billy, filho do cientista. O grupo descobre que a origem dos terremotos é o continente perdido de Atlântida! Porém, dois grupos opostos de habitantes de Atlântida estão em guerra e ameaçam a Terra.