2079. Há 10 anos estamos em guerra com uma poderosa força alienígena que está clonando seres humanos e usando essas réplicas como verdadeiras bombas humanas. Spencer John Olham (Gary Sinise) é um respeitado cientista do governo, prestes a terminar o projeto de uma arma secreta que promete salvar o planeta. Porém repentinamente é acusado de ser um alienígena espião, e se torna alvo de uma implacável caçada humana. Até mesmo Maya Olham (Madeleine Stowe) sua esposa, desconfia dele. Spencer está sozinho e precisa descobrir a verdade. Impiedosamente perseguido por Hathaway (Vincent D´Onofrio), um agente federal encarregado de caçar e destruir os clones, ele terá que enfrentar dois grandes dilemas - provar sua identidade para a polícia secreta a tempo de salvar a humanidade, e provar a própria identidade para si mesmo.